V medicíně je termín extrapyramidový používán prakticky výhradně pro tzv. extrapyramidový systém a s sním související extrapyramidové příznaky a syndromy.
Extrapyramidový systém je část CNS, která není součástí pyramidového systému. Jeho součástí je celá řada ganglií a nervových svazků v míše, hlavní funkcí je regulace hybnosti, regulace svalového napětí, koordinace pohybů a kontrola pohybových automatizmů. Lze tedy říci, že nesprávná funkce extrapyramidového systému sice pohyb umožňuje, ale zhorší jeho koordinaci a kvalitu. Vznikají pak tzv. extrapyramidové syndromy.