Fermentace je odbornější výraz pro kvašení (kvasné procesy). Během fermentace dochází k přeměně složitějších organických látek vlivem bakteriálních enzymů na látky jednodušší, z medicínského hlediska má význam přítomnost fermentačních procesů v tlustém střevě za přítomnosti střevního mikrobiomu.